【目的】谷氧还蛋白(glutaredoxin,GRX)在许多生物的生长发育及抗氧化反应中起着重要的作用。谷氧还样蛋白(glutaredoxi的简体中文翻译

【目的】谷氧还蛋白(glutaredoxin,GRX)在许多生物的生长

【目的】谷氧还蛋白(glutaredoxin,GRX)在许多生物的生长发育及抗氧化反应中起着重要的作用。谷氧还样蛋白(glutaredoxin-like,GRL)是新划分的一种类型,对陆地棉GhGRL基因进行生物信息学分析,为深入研究 GhGRL基因在陆地棉中功能提供基础。【方法】以拟南芥GRL基因为参考基因,从陆地棉基因组数据库中鉴定到的GRL基因进行生物信息学分析和基因表达分析。【结果】共鉴定出33 个GhGRL 基因,它们具有GRX-GRX-Like保守结构域;系统进化树分析发现33个GhGRL基因分为3亚组,每个亚组都有与拟南芥同源的基因;氨基酸多重序列比对表明该家族成员序列相似性约为29.54%;通过基因结构分析,大部分基因无内含子;保守序列分析发现GhGRL基因所编码的氨基酸序列大部分包含4个保守基序,同时4个保守基序与保守结构域重叠;染色体定位分析显示33个基因分散在19个染色体上,而且每条染色体上的GhGRL基因数目有很大的差别;表达谱数据分析表明GhGRL 基因具有较为广泛的组织表达类型。【结论】该研究结果有利于了解棉花GhGRL基因家族的进化,为下一步深入研究该基因家族在生物学功能提供基础。
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【目的】谷氧还蛋白(glutaredoxin,GRX)在许多生物的生长发育及抗氧化反应中起着重要的作用。 谷氧还样蛋白(glutaredoxin-like,GRL)是新划分的一种类型,对陆地棉GhGRL基因进行生物信息学分析,为深入研究 GhGRL基因在陆地棉中功能提供基础。 【方法】以拟南芥GRL基因为参考基因,从陆地棉基因组数据库中鉴定到的GRL基因进行生物信息学分析和基因表达分析。 【结果】共鉴定出33 个GhGRL 基因,它们具有GRX-GRX-Like保守结构域;系统进化树分析发现33个GhGRL基因分为3亚组,每个亚组都有与拟南芥同源的基因;氨基酸多重序列比对表明该家族成员序列相似性约为29.54 %;通过基因结构分析,大部分基因无内含子;保守序列分析发现GhGRL基因所编码的氨基酸序列大部分包含4个保守基序,同时4个保守基序与保守结构域重叠;染色体定位分析显示33个基因分散在19个染色体上, 而且每条染色体上的GhGRL基因数目有很大的差别;表达谱数据分析表明GhGRL 基因具有较为广泛的组织表达类型。 【结论】该研究结果有利于了解棉花GhGRL基因家族的进化,为下一步深入研究该基因家族在生物学功能提供基础。
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[Objective] glutaredoxin (Grx) plays an important role in the growth and antioxidant response of many organisms. Glutaraloxin like (GRL) is a newly classified type. The bioinformatics analysis of ghgrl gene in Upland Cotton provides a basis for further study of the function of ghgrl gene in upland cotton. [Methods] using Arabidopsis GRL gene as reference gene, the GRL gene identified from upland cotton genome database was analyzed by bioinformatics and gene expression. [results] 33 ghgrl genes with grx-grx-like conserved domain were identified. The phylogenetic tree analysis showed that 33 ghgrl genes were divided into three subgroups, each of which had homologous genes with Arabidopsis. The amino acid multiple sequence alignment showed that the similarity of the family members was about 29.54%. Most of the genes had no introns through gene structure analysis and conserved sequence analysis It is found that most of the amino acid sequences encoded by ghgrl gene contain four conserved motifs, and four conserved motifs overlap with conserved domains; chromosome mapping analysis shows that 33 genes are scattered on 19 chromosomes, and the number of ghgrl genes on each chromosome is very different; expression profile data analysis shows that ghgrl gene has a wide range of tissue expression types. [Conclusion] the results of this study are helpful to understand the evolution of cotton ghgrl gene family and provide the basis for further study on the biological function of this gene family.<br>
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