La préparation d'isoformes pratiquement pures de ces protéines est effectuée par chromatographie d'échange cationique de TSK sulfopropyle et par chromatographie liquide en phase inversée de haute performance. Un procédé d'électrophorèse de zone sur colonne capillaire à charge inverse permet la quantification d'isoformes pratiquement pures de ces protéines du fait de modifications post translationnelles endoprotéolytiques. Ces compositions sont des isoformes pratiquement pures de protéines PDGF sécrétées présentant une hétérogénéité structurale, plus particulièrement des isoformes à simple coupure et double coupure, intactes, purifiées, de protéines PDGF-BB de recombinaison. L'invention porte également sur des compositions pharmaceutiques comprenant au moins une de ces isoformes PDGF de