Statistical and Bioinformatic AnalysesStatistical analysis was perform的简体中文翻译

Statistical and Bioinformatic Analy

Statistical and Bioinformatic AnalysesStatistical analysis was performed using PASW v 18, IBM SPSS Statistics 21 (SPSS Inc, Chicago, Illinois) or GraphPad Prism v 5 (GraphPad Software Inc, San Diego, California).Statistical comparisons of clinical data between cases and controls were performed using ANOVA, Tukey post hoc tests, Mann-Whitney test, and Kruskal-Wallis tests, as appropriate. The threshold of statistical significance was set at a Pvalue of .05.Bioinformatic analysis was also performed. All samples in the initial exploratory study were analyzed for miRNA expression using human miRNA microarray 8  15 K release 14.0 (029297) arrays. The data from the microarrays were normalized using variance stabilizing normalization.16 The data were filtered to remove the control probes and those that did not pass the quality filters (ie, those that were undetectable or were not expressed higher than the negative controls in greater than 75% of the samples). After filtering, 259 miRNAs out of 866 were retained for differential expression analysis. All data processing and differential expression analysis was carried out in R using the AgiMicroRNA17 and LIMMA18 packages from Bioconductor 19 P values were corrected for multiple testing using the BenjaminiHochberg method.20Potential molecular targets and signalling pathways of hsa-miR-374a were identified using miRecords. Additional enrichment analyses were carried out using WebGestalt
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统计和生物信息学分析<br>使用PASW 18节进行统计分析,IBM SPSS统计21(SPSS公司,芝加哥,伊利诺伊州)或的GraphPad Prism 5节(格拉夫派得软件公司,加利福尼亚州圣迭戈)。<br>用例和对照组之间的临床数据的统计比较执行ANOVA,Tukey事后检验,Mann-Whitney检验和秩和检验测试,Appro公司?需用合适。统计显着性阈值设置为.05 P值。<br>还进行生物信息学分析。在最初的探索性研究的所有样品进行分析的使用人miRNA芯片8的miRNA表达?15 K释放14.0(029297)阵列。从microar数据γ射线,使用方差稳定normaliza正火?tion.16对数据进行过滤以除去对照探针和那些没有通过质量过滤器(即,那些被检测不到或没有表达比负高在样品的大于75%的对照)。过滤后,259种miRNA出866被保留用于DIF?ferential表达分析。所有的数据处理和差异表达分析用的是AgiMicroRNA17和来自Bio LIMMA18包中的R进行?导体19个P值用于使用所述多个的Benjamini测试校正?霍赫贝格method.20<br>潜在的分子靶点和HSA-MIR-374A的信号传导通路使用miRecords鉴定。进一步富集的分析进行了使用WebGestalt
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统计和生物信息分析<br>统计分析是使用 PASW v 18、IBM SPSS 统计 21(SPSS Inc、 芝加哥、伊利诺斯州)或 GraphPad 棱镜 v 5(GraphPad 软件公司,加利福尼亚州圣地亚哥)进行的。<br>酌情使用ANOVA、图基后临时测试、曼-惠特尼测试和Kruskal-Wallis测试对病例和控制之间的临床数据进行统计比较。统计显著性阈值设置为 0.05 的 P 值。<br>还进行了生物信息分析。使用人类miRNA微阵列8 15 K释放14.0(029297)阵列,对初始探索性研究中的所有样品进行了miRNA表达分析。微阵列中的数据使用方差稳定规范化进行规范化。超过 75% 的样本中的负控制)。过滤后,866 个中的 259 个 miRNA 被保留用于差异表达式分析。所有数据处理和差分表达分析均采用AgiMicroRNA17和来自生物导体19 P值的LIMMA18封装在R中进行,采用本杰明尼霍赫伯格方法进行多次测试。<br>使用 miRecords 确定了 has-miR-374a 的潜在分子靶点和信号通路。使用 WebGestalt 进行了其他浓缩分析
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统计和生物信息分析<br>使用PASW v 18、ibmspsstatistics21(SPSS公司,伊利诺伊州芝加哥)或GraphPad Prism v 5(GraphPad软件公司,加利福尼亚州圣地亚哥)进行统计分析。<br>采用方差分析、图基事后检验、曼惠特尼检验和克鲁斯卡-沃利斯检验对病例和对照组的临床数据进行统计比较。统计显著性阈值设定为0.05。<br>还进行了生物信息学分析。使用人类miRNA微阵列8  15k释放14.0(029297)阵列分析初始探索性研究中的所有样本的miRNA表达。来自微阵列的数据使用方差稳定标准化进行了标准化。16对数据进行过滤,以去除对照探针和未通过质量过滤器的探针(即,在超过75%的样本中,未检测到或未表达高于阴性对照的探针)。过滤后,866个miRNAs中有259个被保留用于差异表达分析。所有数据处理和差异表达分析在R中使用AgimorNa17和LIMMA18包从Bio 导体19 P值进行校正,以进行多次测试,使用Benjamini  Hochberg方法<br>利用miRecords技术鉴定了hsa-miR-374a的潜在分子靶点和信号传导途径。使用WebGestalt进行额外的富集分析
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