Izbira pretoka postopka čiščenja vode in sestavo glavnih struktur je treba določiti s tehnično in ekonomsko primerjavo glede na prvotno kakovost vode, velikost vodne rastline, zahteve glede kakovosti vode in lokalne pogoje.(2) Proizvodno zmogljivost čistilne konstrukcije je treba zasnovati na podlagi največje dnevne porabe vode plus porabe vode same vodne naprave (včasih tudi s porabo dodatne vode za požar) in jo je treba preverjati na podlagi najbolj neugodnih pogojev kakovosti surove vode. Volumen vodne rastline v mestnih vodah je običajno 5 do 10% količine oskrbe z vodo, kar lahko določimo z izračunom, če je potrebno.(3) Pri načrtovanju vodne naprave je treba upoštevati, da lahko vse konstrukcije ali oprema še vedno izpolnjujejo proizvodne zahteve, ko se prenovijo, očistijo in delno ustavijo.