En viktig sak er å forbedre anvendeligheten til hjerne-datamaskin-grensesnittsystemer. Anvendbarhet inkluderer hovedsakelig miljøtilpasning, portabilitet og biokompatibilitet. EEG-innsamling innebærer høye miljøkrav. Amplituden til EEG-signaler er veldig liten og ustabil, under prosessen med å samle EEG-signaler vil den uunngåelig bli forstyrret av andre signaler. Når omgivelsesstøyen er relativt høy, vil det redusere nøyaktigheten til hjerne-datamaskin-grensesnittsystemet. Derfor er det nødvendig å forbedre systemmiljøet for hjerne-datamaskingrensesnittet. Et viktig forskningsspørsmål er tilpasningsevne, og når det gjelder implanterte elektroder, er deres biokompatibilitet en spesielt stor utfordring.