Ker sta molekularna teža in volumen HOCl hipoklorne kisline zelo majhna in je nevtralna molekula, ko razprši na površino negativno nabitih bakterij, lahko prodre v celično membrano in vstopi v notranjost celice ter oksidira atom klora v molekuli HOCl, da uniči celico Encim v njem, da bi dosegli namen sterilizacije.