PCROne hundred twenty-two clinical

PCROne hundred twenty-two clinical A. baumannii strains belonging to either IC I (n = 72) or IC II (n = 50) clonal lineage were screened for the presence of blp1 alleles. Conventional PCR was undertaken using primers listed in Additional file 1: Table S1. Tm was calculated based on the primer sequences. For blp1 gene transcription analysis, clinical A. baumannii strains were grown in LB medium for 16 h. Total RNA was extracted using GeneJET RNA Purification Kit(Thermo Fisher Scientific) according to the manufacturer recommendations. cDNA was synthesized using RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit (Thermo Fisher Scientific). qPCR was performed using primer pairs listed in Additional file 1: Table S1.

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PCR 篩選了屬於IC I（n = 72）或IC II（n = 50）克隆譜系的122株臨床鮑曼不動桿菌菌株是否存在blp1等位基因。使用附加文件1：表S1中列出的引物進行常規PCR。基於引物序列計算Tm。對於blp1基因轉錄分析，將臨床鮑曼不動桿菌菌株在LB培養基中培養16小時。 根據生產商的建議，使用GeneJET RNA純化試劑盒（Thermo Fisher Scientific）提取總RNA 。使用RevertAid First Strand cDNA合成試劑盒（Thermo Fisher Scientific）合成cDNA。使用附加文件1：表S1中列出的引物對進行qPCR。

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Pcr。 對屬於IC I(n = 72)或IC II(n = 50)克隆血統的122個臨床 A. baumannii 菌株進行了篩選,以發現 blp1 等位基因的存在。傳統的PCR是使用附加檔1:表S1中列出的底圖進行的。Tm 是根據底數序列計算的。對於blp1基因轉錄分析,臨床A.鮑曼尼菌株生長在LB介質16小時。使用 GeneJET RNA 純化試劑盒提取總 RNA。 (瑟莫費舍爾科學)根據製造商的建議。cDNA是使用恢復援助第一鏈cDNA合成套件(熱費舍爾科學)合成的。qPCR 是使用附加檔 1:表 S1 中列出的底數對執行的。

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PCR 在BLI-I中，有20株（72株）屬於BⅠ型或B型。使用附加檔1：錶S1中列出的引子進行常規PCR。根據引子序列計算Tm。為了進行blp1基因轉錄分析，臨床鮑曼葡萄球菌在LB培養基中培養16h，用GeneJET RNA純化試劑盒選取總RNA （賽默飛世爾科技）根據製造商建議。cDNA的合成採用回復性第一鏈cDNA合成試劑盒（Thermo Fisher Scientific）。使用附加檔1：錶S1中列出的引子對進行qPCR。

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